La instalación de la réplica de la Capilla Sixtina provocó el desprendimiento de decenas de lajas del atrio de la Catedral de Puebla que datan del siglo XVI, pero la afectación total al inmueble aún no ha sido comunicada por el INAH.
La réplica de la Capilla Sixtina en Puebla se inauguró sin permiso del INAH, y se mantuvo así aun cuando se documentó el daño que causó a la Catedral de Puebla.